Het spel breekt met enkele conventies van de serie. Zo komen veel van de zwakkere tegenstanders niet meer individueel voor, maar in grotere groepen. Link kan zich vrijer bewegen dan ooit tevoren: om een beter overzicht van zijn omgeving te krijgen, kan hij torens en enorme bouwwerken beklimmen en als bergbeklimmer elke berg bedwingen. Met de paraglider zweeft hij vervolgens weer naar beneden, en als dat te langzaam gaat, gebruikt hij gewoon zijn schild als glijbaan voor een snelle afdaling. Zelfs de weersomstandigheden veranderen voortdurend in deze dynamische wereld, en als Link wil overleven, moeten de spelers hier rekening mee houden. Een plotselinge regenbui kan elk kampvuur doven, en bij onweer kunnen metalen wapens bliksem aantrekken. Bovendien moet Link altijd op de juiste kleding letten, want zijn reis voert hem door de meest uiteenlopende gebieden met verschillende klimaten. In deze enorme wereld zijn er meer dan 100 Shrines of Trials vol vallen en puzzels te ontdekken. In welke volgorde de spelers deze verkennen, laten ze helemaal aan zichzelf over. Wanneer Link zich door een shrine vecht, ontvangt hij speciale items en beloningen die hem op zijn verdere reis ten goede komen. De puzzels kunnen vaak op meer dan één manier worden opgelost. Daarnaast zijn er tal van geheimen te onthullen. Verkennen en ontdekken vormt de essentie van het speelplezier in Links nieuwe avontuur.